人称日本警察之救世主的高中生侦察工藤新一在与青梅竹马毛利兰去游乐园游玩时,不经意中创造 了行踪可疑的黑衣人。于是工藤新一尾随跟踪,并目睹了黑衣人正在进行可疑交易。不意 ,却被另一名黑衣人在背后击晕,被强行灌下一种名为APTX-4869的毒药,致使身材变小。为了在不裸露 真实身份并连续 追踪黑衣人及其成员,情急之下,工藤新一受到《福尔摩斯》的作者“阿瑟·柯南·道尔”和“江户川乱步”名字的启发,更名 为“江户川柯南”,并寄住在毛利兰的家中。作为侦察,柯南实在看不下去毛利小五郎经常做的一些“发育不良”的毛病推理,便赞助 毛利小五郎破了许多案子。